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乐投letou生物报路:近日,,,,,上海交通大学性命科学技术学院徐沁、龚清秋课题组合作在Computational and Structural Biotechnology Journal在线颁发题为An Allosteric Regulation Mechanism of Arabidopsis Serine/Threonine Kinase 1 (SIK1) Through Phosphorylation 的钻研论文 。。。。。。。。性命科学技术学院2018级本科生穆俊羲、2020级硕士生周家莉为本文并列第一作者,,,,,性命科学技术学院长聘教轨副教授龚清秋和副钻研员徐沁为共同通讯作者。。。。。。。。
此项工作一连龚清秋课题组对植物Hippo/STE20同职能蛋白SIK1的职能钻研,,,,,从微观角度揭示了SIK1激酶域在磷酸化激活过程中的动态构象变动和残基作用蹊径。。。。。。。。通过对比多种丝/苏氨酸激酶的一维序列和三维结构,,,,,使用同源建模构建了SIK1激酶域在磷酸化激活和去磷酸化失活状态下的不变构象;;;;;通过度子动力学模拟了失活态磷酸化及激活态去磷酸化后的构象变动过程,,,,,基于残基运动有关性揭示了磷酸化位点通过变构效应调控活性口袋开合的残基作用蹊径;;;;;以尝试验证了激活蹊径中若干关键残基对激酶活性的沉要性。。。。。。。。

图1. 磷酸化产生的变构效应调节活性口袋开关
只管SIK1的N-端、C-端序列都是植物特异的并且高度无序,,,,,但其激酶域与人类MST1/2等STE20家族蛋白激酶结构同源性很高,,,,,激活机造拥有高度的类似性。。。。。。。。而这些激酶的激活蹊径中关键氨基酸的序列守旧性与其地点位点的柔性有关:即主题低柔性区类似催化位点残基高度守旧,,,,,而蹊径两端的磷酸化位点和活性调控位点位于高柔性loop区反而允许相对分歧的残基执行类似的职能。。。。。。。。因而,,,,,本钻研了局不仅对植物Hippo通路与器官大幼的钻研有领导意思,,,,,也可为针对动物Hippo/MSTs设计幼分子药物用于癌症医治、器官再生提供结构参考;;;;;还为高柔性无规区域在蛋白质调控中的作用增长了一个典型案例,,,,,为酶工程和蛋白质设计提供了一些新的思虑。。。。。。。。

图2. 推算与尝试相结合揭示的关键残基作用机造
自2015年在国际上初次报路了植物Hippo通路的主题激酶SIK1,,,,,成立了SIK1-MOB1模????椋,,,,并将Hippo/STE20推进细胞割裂退出与极性成立的职能推广到真核生物域后,,,,,龚清秋课题组持续进行植物Hippo通路的高低游组分鉴定,,,,,并发展通路的进化生物学钻延祝。。。。。。。本钻研得到国度天然科学基金、上海交通大学医工交叉项目、性命科学学科群交叉钻研项主张支持。。。。。。。。穆俊羲同学在徐沁副钻研员的领导下,,,,,获得本科生钻研打算(PRP)和大学生创新项主张支持。。。。。。。。
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