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Nature忠告:超过700项钻研的尝试试剂DNA或RNA序列存在谬误


乐投letou生物报路:一项对近1.2万份人类遗传学论文的推算机分析钻研发现,,,,,,,,超过700项钻研的尝试试剂DNA或RNA序列存在谬误。 。。。。。。。澳大利亚悉尼大学(University of Sydney)癌症钻研人员Jennifer Byrn辅导的团队指出,,,,,,,,这是一个“令人忧郁的问题”,,,,,,,,由于这批注有一部门有关人类基因的钻研是不成靠的,,,,,,,,令人忧郁。 。。。。。。。这些谬误可能是无意的,,,,,,,,但钻研人员也疑惑可能存在学术不端。 。。。。。。。

自2015年以来,,,,,,,,Byrn一向在钻研遗传学钻研中的谬误,,,,,,,,其时她在五篇汇报一项常见尝试的论文中发现了问题:使用一幼段DNA使癌细胞中的一个基因失活。 。。。。。。。这些钻研汇报了他们进行的尝试中出现了谬误的核苷酸序列,,,,,,,,而这并不是这些论文唯一的问题,,,,,,,,文章还使用了类似的说话和数据,,,,,,,,Byrn疑惑它们论文造作商的产品。 。。。。。。。目前四篇论文已经被退回。 。。。。。。。

Byrn持续寻找有类似谬误的论文。 。。。。。。。到2017年,,,,,,,,她与法国格勒诺布尔大学推算机科学家Cyril Labbé合作,,,,,,,,开发了名为Seek & Blastn的软件,,,,,,,,能够象征潜在的谬误。 。。。。。。。它从论文中提取短核苷酸序列,,,,,,,,并与公共核苷酸数据库Blastn进行比力,,,,,,,,查抄它们是否与应该靶向的人类基因匹配。 。。。。。。。钻研人员也手动查抄每个象征不匹配。 。。。。。。。

为了衡量这个问题的严沉水平,,,,,,,,钻研幼组筛选了他们知路之前颁发过出缺点的论文的两家杂志:Gene(钻研幼组查抄了2007年至2018年颁发的所有7400篇原创论文)和Oncology Reports(2014年至2018年颁发的所有3800篇盛开获取论文)。 。。。。。。。经过人为查抄,,,,,,,,在Oncology Reports查抄的论文中,,,,,,,,约有12%的论文出现了谬误。 。。。。。。。

有针对性的搜索

Byrne和她的团队还指出了癌症遗传学的三个子领域,,,,,,,,他们此前在这些领域发现了问题:关于特定类型的microRNA 在癌细胞中的作用的论文 ;;;;;;报路顺铂或吉西他滨医治癌细胞或癌症患者的论文 ;;;;;;还有一些论文报路相识除17个基因中的任何一个的活性,,,,,,,,从而确定它们在癌细胞中的职能。 。。。。。。。钻研幼组发现,,,,,,,,在这些亚领域的约600篇论文中,,,,,,,,超过25%的论文含有核苷酸序列谬误。 。。。。。。。

Portrait of Jennifer Byrne.            

Jennifer Byrn

 

 

钻研人员在7月31日颁发在bioRxiv上的一份预印本中说,,,,,,,,总共有712篇论文——约占筛查总数的6%——在其核苷酸试剂的序列中存在谬误。 。。。。。。。这些钻研颁发在78份期刊上,,,,,,,,被引用总数超过17000次。 。。。。。。。(其中29项钻研颁发在Springer Nature上,,,,,,,,Nature暗示将对有关论文进行调查)。 。。。。。。。在712项钻研中,,,,,,,,只有11项被撤回,,,,,,,,3项表白了忧郁。 。。。。。。。Byrne说,,,,,,,,她的团队此刻已经给所有有关期刊或出版商的编纂发了电子邮件,,,,,,,,他们能够找到联系方式,,,,,,,,有些人回复说他们将调查这些论文。 。。。。。。。

Oncology Reports主编、病毒学家Demetrios Spandidos通知Nature杂志,,,,,,,,Byrne已经联系了他,,,,,,,,但还没有足够的功夫来评估手稿中描述的所罕见据。 。。。。。。。Gene杂志的主编、分子生物学家Andre Van Wijnen没有回应。 。。。。。。。

无意的谬误?

Byrne说,,,,,,,,有些问题可能是无意的谬误。 。。。。。。。但是,,,,,,,,她说钻研人员发现了很多不太可信的谬误,,,,,,,,好比聚合酶链反映本利用来扩增DNA。 。。。。。。。

钻研人员写路:“我们发现,,,,,,,,人类基因职能论文中核苷酸序列谬误的比例高得令人难以接受,,,,,,,,这对旨在将基因组学投资转化为患者的钻研领域是一个沉大挑战。 。。。。。。。」剽样浪费了科学家试图跟踪此类钻研的功夫,,,,,,,,最坏的情况是,,,,,,,,论文可能是伪造的,,,,,,,,钻研可能不成靠。 。。。。。。。 

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