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中表学者PNAS合作实现玉米B染色体精密图谱和职能钻研


乐投letou生物报路:早在一个多世纪前发现B染色体在好多植物、动物和真菌基因组中宽泛存在。。。。。。B染色体对于个别的性命活动来说不是必须的,, ,, ,,,但它们依然通过分歧的机造存在于种群钟祝。。。。。例如玉米B染色体不与任何A染色体配对,, ,, ,,,其传递不遵循孟德尔遗传定律,, ,, ,,,花粉第二次有丝割裂B染色体味产生不分离(nondisjunction),, ,, ,,,蕴含B染色体的精核优吓纂卵细胞受精,, ,, ,,,使其可能在群体中传递与累积。。。。。。早期的玉米遗传学家利用A-B染色体易位系统创造丰硕的染色体变异资料,, ,, ,,,宽泛利用于玉米遗传学、人为染色体、基因剂量效应和着丝粒钻延祝。。。。。例如在玉米中发现失活的B着丝?????D芄徊槐湟糯(Han et al., PNAS, 2006);; ;;;失活的B着丝粒依然拥有不分离的职能,, ,, ,,,并能够恢新生性(Han et al., Plant Cell, 2007;2009);; ;;;利用B着丝粒与A染色体易位系探求麦克林托克多年前提出的BFB理论(Birchler and Han, Plant Cell, 2018);; ;;;利用B着丝粒错割裂资料具体钻研新着丝粒形成(Zhang et al., Plant Cell, 2013;Liu et al., PNAS 2015)。。。。。。B染色体为植物染色体生物学的发展做出了沉要贡献,, ,, ,,,然而关于玉米B染色体的发源、进化及其在群体中堆集的分子机造等关键问题依然鲜为人知。。。。。。 

  美国密苏里大学James A. Birchler钻研组、捷克科学院尝试植物钻研所Jan Barto??????钻研组以及中国科学院遗传与发育生物学钻研所韩方普钻研组经过多年合作,, ,, ,,,共同实现玉米B染色体的基因组图谱,, ,, ,,,解析了玉米B染色体的发源、进化及不分离的机造。。。。。。钻研团队利用染色体分选、Illumina测序、Bionano光学图谱、Hi-C等步骤相结合组装出328个B染色体特异的scaffolds,, ,, ,,,总长度125.9 Mb。。。。。。随后利用B-A染色体易位、B着丝粒错割裂和B染色体断裂等特殊资料,, ,, ,,,构建染色体水平的分子图谱,, ,, ,,,注解出758个蛋白质编码基因,, ,, ,,,其中至少有88个基因表白。。。。。。B染色体蛋白编码基因的同源物宽泛散布在玉米10条A染色体上,, ,, ,,,但是A染色体没有检测到B染色体共线性的基因区域,, ,, ,,,揣摩当前B染色体的基因是持久进化过程由A染色体陆续转移,, ,, ,,,随后产生部门降解的了局,, ,, ,,,这些保留下来的基因代表经过选择参加B染色体的职能维持,, ,, ,,,例如和“着丝粒区域”、“纺锤丝微管”、“胞质割裂的调节”、“组蛋白丝氨酸磷酸化”以及“染色体分离”等有关。。。。。。进一步通过转座元件的分析发现玉米B染色体60%的序列由转座元件组成,, ,, ,,,其类型和A染色体根基一样。。。。。。B染色体基因和转座元件的含量以及对转座蛋白编码基因的选择分析批注B染色体在进化世代中已经存在数百万年。。。。。。 

  B染色体鉴定到574-kb的职能着丝粒序列,, ,, ,,,除了和A着丝粒共享CentC和CRM类型的沉复序列表,, ,, ,,,还蕴含B着丝粒特异的串联沉复序列B-repeat。。。。。。着丝粒结构分析批注B着丝粒CENH3核幼体的结构和职能与A着丝粒类似。。。。。。高质量的B染色体序列图谱和遗传分析揭示B染色体不分离有关的顺式因子散布在着丝粒及其周围B染色体特异的沉复序列上。。。。。。通过B-3Sb缺失mapping,, ,, ,,,鉴定到B染色体结尾34个蛋白编码基因可能作为反式作用元件参加不分离过程。。。。。。B染色体转座沉复基因可能进化出很多新职能,, ,, ,,,以维持种群中这种非必须染色体的存在。。。。。。玉米B染色体精密图谱为进一步深刻钻研B染色体的个性提供了参考信息。。。。。。 

 

  该论文于2021年6月5日在线颁发于PNAS(DOI:10.1073/pnas.2104254118),, ,, ,,,Nicolas Blavet、杨华、苏汉东博士为该论文的共同第一作者,, ,, ,,,James A. Birchler、Jan Barto??????和韩方普钻研员为共同通讯作者。。。。。。本工作得到国度天然科学基金委沉点国际合作钻研项主张支持。。。。。。 

    

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图: 玉米B染色体精密图谱和职能钻研 

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