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TMPRSS2-ERG融合基因是前列腺细胞命运决定的关键转录因子


乐投letou生物报路:肿瘤的肇始和进展过程中往往陪伴着肿瘤细胞的退分化景象,,, ,,但是早期对去势医治敏感的前列腺癌细胞却维持着终末分化的管腔细胞表型。。。。。近期的钻研批注,,, ,,前列腺癌细胞中基因突变较少,,, ,,但是却都存在大量的染色体缺失、沉排、融合、扩增等异常景象。。。。。其中有50%的前列腺癌病人含有TMPRSS2基因与ERG基因融合,,, ,,这也是目前在前列腺癌中最普遍的一种染色体沉排。。。。。固然TMPRSS2-ERG基因的融合是前列腺癌病人中最常见的一种基因沉排,,, ,,但是目前TMPRSS2-ERG基因融合仅作为一种检测前列腺癌的一种分子标识。。。。。

前列腺癌细胞中这种大量存在的染色体异?? ???赡苡肭傲邢傧赴拿司龆ㄇ钻怯泄,,, ,,但是前列腺癌细胞的命运决定机造却一向是前列腺癌钻研领域悬而未决的沉要科学问题。。。。。在该项钻研中,,, ,,钻研人员全面地解析了与前列腺癌细胞命运决定有关的转录因子,,, ,,并发现TMPRSS2-ERG融合基因与前列腺癌细胞的管腔细胞表型高度有关。。。。。

中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学钻研所)高栋钻研组在国际学术期刊Journal of Clinical Investigation上在线颁发题为 “ERG orchestrates chromatin interactions to drive prostate cell fate reprogramming”的钻研成就。。。。。该钻研利用类器官造就技术、基因工程编纂幼鼠、CRISPR-Cas9基因编纂技术、多组学测序技术和生物信息学数据分析发现TMPRSS2-ERG融合基因通过调控染色质的相互作用来决定前列腺细胞的命运。。。。。
 
为钻研TMPRSS2-ERG融合基因与前列腺细胞命运决定的关系,,, ,,高栋钻研组钻研人员首先构建过表白TMPRSS2-ERG融合基因的基因工程幼鼠和前列腺类器官,,, ,,通过病理学和分子细胞生物学检测,,, ,,结合转录组测序(RNA-Seq)、染色质盛开性测序(ATAC-Seq)、染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq),,, ,,进一步说明TMPRSS2-ERG融合基因是前列腺细胞命运决定的关键转录因子。。。。。

其次,,, ,,通过RNA-Seq、ATAC-Seq和ChIP-Seq的生物信息学整合分析发现Trp63和TMPRSS2-ERG融合基因是决定前列腺细胞命运的两大关键转录因子。。。。。进一步,,, ,,钻研人员通过三维染色体构象捕获技术(BL-Hi-C)和ChIP-Seq整合分析发现调控Trp63表白的超等加强子,,, ,,并且发现TMPRSS2-ERG通过结合这一调控Trp63表白的超等加强子来降低Trp63的表白,,, ,,从而决定前列腺细胞的命运。。。。。

最后,,, ,,通过CRISPR-Cas9基因编纂技术将TMPRSS2-ERG在这一超等加强子内的结合位点敲除以来,,, ,,发现前列腺癌细胞的命运出现逆转。。。。。综上所述,,, ,,这一钻研解析了早期前列腺癌细胞维持着终末分化命运的原因,,, ,,发现了TMPRSS2-ERG融合基因是前列腺细胞命运决定的关键转录因子。。。。。

原文标题:

ERG orchestrates chromatin interactions to drive prostate cell fate reprogramming

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