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清华大学性命学院颉伟钻研组与中国科学院生物物理钻研所朱冰钻研组通过缜密合作,,,,,在《天然-遗传》期刊以长文大局颁发了题为“不精确DNMT1与邻近区域依赖建改机造推进不变且可塑表观遗传”(Imprecise DNMT1 activity coupled with neighbor-guided correction enables robust yet flexible epigenetic inheritance)的钻研论文,,,,,说明表观遗传建饰在并不精确的维持机造作用下若何维持不变遗传的根基机理。。。。。。
这一沉要钻研发现了不精确的DNMT1甲基化活性(蕴含重新甲基化活性与并不美满的甲基化维持活性)能导致随机DNA甲基化“突变”(epimutations)。。。。。。然而这些“表观遗传突变”在细胞传代过程中偏差于进行自我建复。。。。。。
有趣的是,,,,,该建复可能正是通过DNMT1的不精准活性。。。。。。并且这种不精准活性还能实现对分歧肇始甲基化水平的不变遗传,,,,,进而同时实现表观建饰的可塑性和可遗传性(robust yet flexible epigenetic inheritance)。。。。。。这样一套表观遗传可塑性遗传机造的主题是基于对邻近区域甲基化水平敏感的DNMT1活性的“调节-不变”系统(neighbor-guided correction)。。。。。。钻研人员相信类似系统可能在表观遗传建饰的传递过程中宽泛存在。。。。。。
在该钻研中,,,,,钻研人员成立了一种“DNMT1-only”的幼鼠胚胎干细胞系,,,,,发现DNMT1-only单细胞克隆群体细胞DNA甲基化依然出现内部细胞的异质性。。。。。。同时,,,,,该甲基化组依然可能在细胞扩增及分化过程中不变地传递。。。。。。进一步的机造钻研显示:1)DNMT1拥有不精确的甲基化维持活性和低水平重新甲基化活性,,,,,导致自觉“表观遗传突变”的产生;;;;;2)这些表观遗传突变在细胞扩增过程中偏差于被一种邻近区域甲基化水平敏感的建改机造所建复;;;;;3)在这种邻近区域甲基化水平依赖的建改系统中,,,,,DNMT1的邻近区域敏感的重新甲基化活性与甲基化维持活性阐扬了沉要作用;;;;;4)模拟推算了局和全基因组单碱基分辨率重新甲基化及维持活性图谱进一步证实DNMT1的重新甲基化活性与邻近区域的甲基化水平有关。。。。。。
最后,,,,,钻研人员发现基因组中分歧区域拥有分歧的DNMT1重新甲基化和维持活性,,,,,好比H3K9me2/3富集的区域拥有更高水平的重新甲基化活性,,,,,CpG岛区域则拥有较低的甲基化维持活性及重新甲基化活性,,,,,进而提供了基因组分歧调控序列上分歧甲基化水平维持的新机造。。。。。。
综上所述,,,,,该工作系统地钻研了表观建饰若何在不精确遗传模式下实现不变且可塑性遗传,,,,,发现了表观建饰邻近区域依赖的建改新机造,,,,,为理解表观遗传建饰的遗传以及分歧调控元件上DNA甲基化的维持机造提供了新思路。。。。。。
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