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PNAS:HYL1拮抗表切体调控miRNA加工天生新机造


乐投letou生物报路:复旦大学遗传工程国度沉点尝试室任国栋钻研员课题组在〖国科学院院刊》(PNAS)上颁发了题为《双链RNA结合蛋白HYL1 ; ;;;;;iRNA前体分子免受核内表切体攻击》“Hyponastic Leaves 1 protects pri-miRNAs from nuclear exosome attack”的钻研论文。。。。。。。。该钻研揭示了拟南芥双链RNA结合蛋白 HYL1在 miRNA加工成熟过程中 ; ;;;;;さ孜锓肿樱╬ri-miRNA及其加工过程中央产品)免受核酸表切体(exosome)攻击的新机造,,,,,并发现HYL1可能在DCL1介导的由环到基部(Loop-to-base)和基部到环(Base-to-loop)成熟的pri-miRNAs 加工过程中阐扬分歧作用。。。。。。。。

miRNA是一类长度在20-24碱基的内源幼分子RNA,,,,,在动植物成长发育、细胞命运决定和转换、以及环境应答等险些所有生物学过程中阐扬沉要作用。。。。。。。。miRNA低级转录本(称为pri-miRNA)能够折叠成茎区不齐全配对的发夹结构,,,,,该结构可被RNase III家族核酸内切酶鉴别并切割后开释出成熟的双链miRNA/miRNA*。。。。。。。。和动物相比,,,,,植物 pri-miRNA的茎环区长度变异更大(从60 nt到超过500 nt,,,,,动物中通常为~70 nt),,,,,从而增长了茎环结构的复杂性。。。。。。。。因而植物除了经典的基部到环的加工方式,,,,,不少miRNA以环到基部的切割方式成熟,,,,,有些长的pri-miRNA还存在两次以上的陆续切割 。。。。。。。。

在植物中,,,,,DCL1在HYL1和锌指蛋白SE等的援手下掌管绝大无数miRNA的加工成熟。。。。。。。。HYL1被以为是DCL1最沉要的伴侣分子,,,,,揣摩其在miRNA加工过程中的职能类似于动物miRNA天生中Drosha的伴侣蛋白DGCR8和Dicer的伴侣蛋白TRBP。。。。。。。。已有的钻研批注HYL1有助于提高DCL1加工的效能和正确性,,,,,但其具体的作用机造以及HYL1是否还有其他生物学职能仍不明显。。。。。。。。

表切体是生物体最重要的掌管各类RNA降解的蛋白质机械,,,,,在rRNA加工成熟、正常RNA周转降解以及非正常RNA(如谬误转录本、RNA加工副产品、靶基因切割产品等)的实时断根等细胞根基性命活动过程中阐扬关键作用。。。。。。。。表切体主题复合物共含9个蛋白(Exosome 9,,,,,exo9),,,,,在古菌和真核生物中高度守旧。。。。。。。。主题复合物通过与分歧辅助因子互作参加分歧RNA底物的鉴别和降解。。。。。。。。凭据亚细胞定位的分歧,,,,,表切体可分为胞质表切体与核内表切体,,,,,核内表切体又分为核仁表切体与核质表切体。。。。。。。。RNA解旋酶SKI2、MTR4以及HEN2别离是胞质表切体、核仁表切体与核质表切体的沉要辅助成员。。。。。。。。

钻研通过正向遗传学筛选hyl1-2的表型抑造子,,,,,结合图位克隆分离鉴定到核质表切体的另一辅助因子SOP1。。。。。。。。SOP1蛋白C端含有5个串联的CCCH型锌指结构,,,,,可能与RNA结合有关。。。。。。。。SOP1与HEN2共定位,,,,,参加部门核质表切体靶标RNA的降解。。。。。。。。在hyl1-2中引入HEN2的突变同样能够显著抑造hyl1-2的发育缺点,,,,,批注SOP1和HEN2很可能是通过表切体蹊径参加miRNA调控的 。。。。。。。。通过对miRNA以及pri-miRNA的结合分析发现,,,,,hyl1 sop1 双突变体中加工方向为环到基部的pri-miRNA较hyl1有更高的堆集,,,,,对应成熟miRNA表白水平得到了显著回复,,,,,批注SOP1选择性参加hyl1突变体中加工方向为环到基部的pri-miRNA降解。。。。。。。。

令人惊讶的是,,,,,hyl1 hen2双突变体中险些所有的pri-miRNA均显著累积,,,,,但是只有环到基部成熟的miRNA得到了回复。。。。。。。。该钻研了局批注当HYL1缺失时,,,,,环到基部加工的pri-miRNA的更多累积能够推进miRNA的天生,,,,,而基部到环加工的pri-miRNA则不能。。。。。。。。加工复合体成员SE可能与HEN2相互作用,,,,,猜测可能在招募表切体中阐扬职能。。。。。。。。

该钻研揭示了表切体在pri-miRNA生物产生中的监控作用以及加工复合体主题成员HYL1的 ; ;;;;;ぶ澳埽,,,,拓展了我们对于加工过程中pri-miRNA质量节造机造的意识。。。。。。。。此表,,,,,该钻研还系统鉴定了受HEN2、SOP1影响的差距表白基因,,,,,这些基因可作为核质表切体职能的标志基因。。。。。。。。

任国栋课题组博士后高帅(现工作于广东省生物工程钻研所)、博士钻研生王镜谕以及性命学院姜宁青年副钻研员为本文的共同第一作者,,,,,任国栋钻研员为通讯作者,,,,,复旦大学为第一单元。。。。。。。。遗传工程国度沉点尝试室常芳教授、王应祥教授以及蒯本科教授团队参加了本项主张钻研 ; ;;;;;晶能生物技术(上海)有限公司提供了测序方面的技术支持。。。。。。。。该钻研受国度天然科学基金和国度沉点研发打算项目赞助。。。。。。。。

原文标题:

Hyponastic Leaves 1 protects pri-miRNAs from nuclear exosome attack

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