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中科院,,,,,,上海????萍即笱ell子刊颁发基因编纂技术系统性综述


乐投letou生物报路:2020年6月30日,,,,,,中科院上海营养与健全钻研所杨力与上海????萍即笱悦蒲в爰际跹г撼录呀淌,,,,,,应邀在国际驰名学术期刊《Trends in Biochemical Science》上颁发题为“A Tale of Two Moieties: Rapidly Evolving CRISPR/Cas-Based Genome Editing”的综述论文,,,,,,从全新的角度对CRISPR/Cas基因组编纂技术的创建和利用进行全面总结,,,,,,并对该领域将来可能的发展方向进行了瞻望 。。。。。。。

通常情况下,,,,,,基因组编纂系统必要两个重要的机关组分来实现精准的基因组DNA编纂,,,,,,一个鉴别基因组DNA特定地位的定位子(locator)和一个对特定基因组DNA进行催化操作的操作子(effector) 。。。。。。。例如,,,,,,早期的基因组编纂系统ZFN和TALEN,,,,,,别离是将ZF或TALE作为locator与Fok IDNA内切酶作为effector结合,,,,,,能够对基因组DNA进行操作 。。。。。。。

近年来,,,,,,利用细菌的CRISPR/Cas免疫系统发展起来的新一代基因组编纂技术在基础科学和利用钻研方面都获得了一系列革命性的突破 。。。。。。。CRISPR/Cas自身既拥有与基因组DNA相结合的locator结构域,,,,,,也拥有切割基因组DNA序列的effector结构域,,,,,,其操作轻便、正确度和编纂效能高,,,,,,因而在生物医学钻研中被宽泛利用 。。。。。。。更为沉要的是,,,,,,近些年来,,,,,,钻研人员将CRISPR/Cas基因编纂酶(如CRISPR/Cas9、CRISPR/Cas12a、CRISPR/Cas13等)与核酸脱氨编纂酶(如胞嘧啶脱氨酶APOBEC/AID、腺嘌呤脱氨酶突变体TadA或ADAR等)和回转录酶(如莫洛尼氏鼠白血病毒回转录酶MMLV)整合发展出的碱基编纂系统(Base Editor, BE)和导向编纂系统(PrimeEditor,,,,,,PE),,,,,,可在单碱基水平实现精准高效的靶向性基因编纂 。。。。。。。

在该综述论文中,,,,,,杨力钻研员和陈佳教授重要对基于CRISPR/Cas的新型编纂系统的创建和利用进行了详尽的梳理;;;;;结合其在纠正人类疾病有关突变的利用对这些新型编纂系统的优、弊端进行了总结;;;;;针对这些编纂系统潜在的基因组和转录组突变机造进行了探求,,,,,,并提出了将来可能的解决规划 。。。。。。。

杨力钻研员持久从事推算生物学和基因编纂新技术钻研 。。。。。。。其钻研组近期与上海????萍即笱С录呀淌谕哦拥确⒄购献,,,,,,阐了然APOBEC在CRISPR/Cas9引起的基因组DNA断裂建复过程中产生突变的分子机造( Lei et al., 2018, Nat Struct Mol Biol );;;;;已成功创建四个系列十多种新型碱基编纂系统,,,,,,蕴含可降低副产品的eBE系统( Wang et al., 2017, Cell Res )、可在高GC区域和高甲基化区域进行高效碱基编纂的普适型hA3A-BE系统( Wang et al., 2018, Nat Biotechnol )、可在A/T富集区域进行碱基编纂的dCpf1-BE(dCas12a-BE)( Li et al., 2018, Nat Biotechnol )系统和只激活本底水平DNA危险响应通路的BEACON系统( Wang et al., 2020, Cell Rep )、并对已报路的一系列碱基编纂系统发展效能比力和潜在利用分析钻研( Wang et al., 2019, Genome Biol ) 。。。。。。。

在钻研过程中,,,,,,杨力钻研组和合作团队还报路了利用碱基编纂系统进行人类遗传突变纠正的预测系统BEable-GPS(Base Editable prediction of GlobalPathogenic SNVs, http://www.picb.ac.cn/rnomics/BEable-GPS)和预测全转录组RNA编纂的推算分析流程RADAR(RNA-editing analysis pipeline to decode alltwelve types of RNA-editing events, https://github.com/YangLab/RADAR),,,,,,也受邀颁发一系列基因编纂有关的评论和综述论文( Yang et al., 2019, CRISPR J; Chen et al., 2019, Nat Biotechnol; Yang et al., 2019, Cell ) 。。。。。。。

原文标题:

A Tale of Two Moieties: Rapidly Evolving CRISPR/Cas-Based Genome Editing

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