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北京大学最新论文:新型探针大规模分析炎症巨噬细胞中的衣康酸建饰


乐投letou生物报路:衣康酸是近些年来被发现拥有显著抗炎抗菌活性的代谢物分子 ,,, ,,,,,它在病原菌侵染或者脂多糖刺激的炎症巨噬细胞中会大量产生 ,,, ,,,,,浓度可达到毫摩级别 ,,, ,,,,,并宽泛参加到抗炎信号通路中。。。。。。由于衣康酸拥有共轭不鼓和双键结构 ,,, ,,,,,它能够通过迈克尔加成反映共价建饰蛋白质中的半胱氨酸残基 ,,, ,,,,,通过影响底物蛋白的活性和职能从而调节炎症反映过程。。。。。。

近日 ,,, ,,,,,北京大学化学与分子工程学院、北京大学合成与职能生物分子中心、北大-清华性命科学结合中心王初课题组在 Journal of American Chemical Society 杂志上颁发了题为“Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probesin inflammatory macrophages”的论文。。。。。。在这项工作中 ,,, ,,,,,他们开发了新型衣康酸建饰探针工具 ,,, ,,,,,并结合定量化学蛋白质组学技术 ,,, ,,,,,初次实现了炎症巨噬细胞中衣康酸建饰半胱氨酸位点的大规模直接鉴定 ,,, ,,,,,并且进一步揭示了衣康酸对细胞法式性坏死过程的调节作用。。。。。。

此前 ,,, ,,,,,王初课题组和陈兴课题组共同合作发展了新型半胱氨酸靶向非天然糖探针 ,,, ,,,,,并结合竞争性化学蛋白质组学技术初次在组学水平上对衣康酸的半胱氨酸建饰位点进行系统的分析 ,,, ,,,,,并成功发现了260个高相信度的衣康酸建饰位点。。。。。。其中 ,,, ,,,,,衣康酸能够建饰和抑造糖酵解通路中关键蛋白ALDOA ,,, ,,,,,LDHA和GAPDH ,,, ,,,,,进行负反馈调节抵抗炎症(Nature chemical biology 2019, 15 (10), 983-991.)。。。。。。

然而 ,,, ,,,,,该步骤只能在细胞裂解液中进行 ,,, ,,,,,并且由因而一种基于竞争象征的步骤 ,,, ,,,,,所以只能间接地检测衣康酸在半胱氨酸上的建饰。。。。。。为相识决以上局限性 ,,, ,,,,,在本工作中 ,,, ,,,,,作者们发展了一种带有生物正交基团的新型衣康酸探针——ITalk, 它能够有效地进入细胞中并实现活细胞内衣康酸建饰蛋白的直接捉拿 ,,, ,,,,,再结合定量蛋白质组学对衣康酸建饰蛋白和位点进行大规模分析和鉴定。。。。。。

作者们在炎症诱导的巨噬细胞中鉴定到属于862个蛋白的1164个半胱氨酸位点 ,,, ,,,,,这其中蕴含很多参加到炎症免疫响应和宿主防御有关调节通路中的关键蛋白 ,,, ,,,,,例如炎性幼体、信号转导、转录和细胞殒命有关蛋白 ,,, ,,,,,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞职能。。。。。。

其中 ,,, ,,,,,作者们发现法式性坏死通路中的关键蛋白RIPK3的Cys360为衣康酸重要的建饰位点 ,,, ,,,,,且衣康酸在该位点的建饰可能推进RIPK3和下游蛋白MLKL的磷酸化 ,,, ,,,,,从而推进RIPK3信号通路介导的细胞坏死。。。。。。

原文标题:

Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probesin inflammatory macrophages

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