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Cell Res:哺乳动物存在DNA 6mA新起源


丽江乐投letou生物报路:中国科学院生态环境钻研中心环境化学与生态毒理学国度沉点尝试室汪海林钻研组在哺乳动物基因组DNA N6-甲基腺嘌呤钻研方面获得新进展。。。。。他们发展了一套独有的、无传染的6mA分析步骤,,,,,在哺乳动物细胞系中检测到的6mA并不依赖于甲基化转移酶,,,,,并发现了DNA聚合酶依赖的DNA 6mA新起源。。。。。有关工作近日以N6-methyladenine is incorporated into mammalian genome by DNA polymerase为题在Cell Research杂志上颁发。。。。。

DNA N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine, 6mA)是一种在原核生物中宽泛存在的表观遗传建饰,,,,,但是高档真核生物中6mA的存在一向是一个难解的谜。。。。。2015年,,,,,汪海林组与陈大华组合作在Cell上颁发了关于果蝇DNA 6mA建饰的钻研成就。。。。。哺乳动物DNA 6mA的钻研也随后开启了新的里程。。。。。

但是,,,,,由于哺乳动物DNA在样品造备和分析过程中,,,,,容易受到原核生物DNA传染,,,,,而原核生物6mA 水平远高于哺乳动物的,,,,,为哺乳动物DNA 6mA的正确检测与钻研带来巨大挑战。。。。。同时,,,,,钻研人员也因而猜疑:哺乳动物基因组DNA中是否存在复造后可遗传性的N6-腺嘌呤甲基化建饰?????? ?该问题一度引起业内宽泛关注与争议。。。。。

为了回覆这一问题,,,,,汪海林钻研组发展了一套独有的、无传染的6mA分析步骤,,,,,在样品预处置、超高效液相色谱串联质谱(UHPLC-MS/MS)分析中排除可能的原核生物DNA的传染,,,,,可获得正确的6mA信号。。。。。利用这一先进的分析步骤,,,,,在三种人细胞系和幼鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells, mES细胞中检测到6mA(图1a, b)。。。。。钻研还发现6mA可在细胞G1期累积。。。。。

为了进一步索求6mA的起源,,,,,该组选取他们研发的一种怪异的不变同位素象征步骤。。。。。该法使用[15N5]-dA作为初始示踪剂处置细胞。。。。。其中,,,,,[15N5]-dA通过补救合成蹊径以[15N4]-dA的大局掺入基因组DNA中。。。。。理论上也可用于鉴别哺乳动物细胞内甲基化转移酶产生的6mA ([15N4]-6mA)。。。。。钻研发现,,,,,经[15N5]-dA处置后,,,,,细胞DNA被[15N4]-dA有效象征,,,,,但未能在mESC等细胞系、分歧细胞周期中检测到任何[15N4]-6mA。。。。。

该钻研选取了第二种有效的同位素象征试剂,,,,,即[13CD3]-L-甲硫氨酸,,,,,但依然未检检测到任何[13CD3]-6mA。。。。。以上了局批注,,,,,在哺乳动物细胞系中检测到的6mA并不依赖于甲基化转移酶。。。。。

他们揣摩细胞内6mA起源于特定DNA聚合酶的活动。。。。。据此,,,,,选取6mA核苷直接处置mES细胞,,,,,基因组DNA中可检测到剂量依赖的6mA掺入。。。。。随后,,,,,别离用同位素象征的[15N5]-6mA和RNA核苷[CD3]-m6A处置细胞进行验证,,,,,可别离检测到[15N5]-6mA和[CD3]-6mA掺入。。。。。

那么mES细胞6mA是若何进入基因组的呢?????? ?钻研发现,,,,,与非同步化的细胞相比,,,,,G1期细胞中DNA聚合酶X家族成员非模板依赖性的Polλ的mRNA表白增长,,,,,而Poly λ敲低则显著降低了G1期和sub G1期6mA水平。。。。。且Polλ敲除可导致[CD3]-m6A处置掺入的6mA削减。。。。。

原文标题:

N6-methyladenine is incorporated into mammalian genome by DNA polymerase

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