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RYBP-/YAF2-PRC1复合物和组蛋白H1介导染色质压缩协同推进H2AK119ub舒展和继承


丽江乐投letou生物报路: 中科院生物物理钻研所李国红课题组在Nature Cell Biology上颁发了“RYBP/YAF2-PRC1 complexes and histone H1-dependent chromatin compaction mediate propagation of H2AK119ub1 during cell division”的文章。 。。。。。。 。该钻研系统论述了组蛋白建饰H2AK119ub1在染色质上舒展以及跨细胞周期继承的具体机造。 。。。。。。 。

  真核细胞内,,,,,染色质是表观遗传信息的重要调控界面。 。。。。。。 。诸多表观遗传因子通过调节染色质结构的盛开与关关,,,,,节造了基因的表白与寡言,,,,,从而维持了分歧谱系细胞内基因的差距表白。 。。。。。。 。其中,,,,,多梳抑造复合物1(PRC1)是一类沉要的表观遗传调控因子,,,,,它重要通过压缩染色质结构和催化形成H2AK119ub1建饰这两种蹊径推进了兼性异染色质的形成,,,,,并以此维持了PRC1靶基因的寡言状态[1]。 。。。。。。 。H2AK119ub1在染色质部门往往连缀不休形成非?????泶蟮腍2AK119ub1区域,,,,,但是其产生的机造一向未被解析。 。。。。。。 。

  李国红课题组结合核幼体pull-down、体表泛素化、TetR-TetO靶向和CHIP-seq等尝试发现RYBP和YAF2蛋白能通过ZNF结构域特异鉴别并结合H2AK119ub1,,,,,借此使RYBP-PRC1和YAF2-PRC1复合物与其催化产品之间形成所谓的“酶-产品之间的正反馈机造”,,,,,从而推进了H2AK119ub1向周边的舒展。 。。。。。。 。

   有趣的是,,,,,通过基于组蛋白建饰和DNaseI高敏位点的染色质状态分析,,,,,作者发现H2AK119ub1重要散布在结构缜密的异染色质区域,,,,,因而提出极度规PRC1介导的H2AK119ub1舒展也可能受到染色质高级结构的调控。 。。。。。。 。之前,,,,,李国红和朱平课题组合作,,,,,利用冷冻电镜技术解析了组蛋白H1压缩30nm染色质纤维的高精度结构,,,,,揭示染色质纤维是以四核幼体为结构单元的左手双螺旋结构,,,,,并发现相间核幼体之间的相互作用在维系四核幼体内部和四核幼体之间的不变性中阐扬了沉要作用[2]。 。。。。。。 。

   因而,,,,,30nm染色质纤维可能通过核幼体-核幼体配对(nucleosome-pairing)的方式推进了极度规PRC1介导的H2AK119ub1在染色质纤维上的舒展。 。。。。。。 。;;;;诟萌绻,,,,作者进行了进一步的尝试并发现H1压缩的30nm染色质纤维简直推进了H2AK119ub1向邻近染色质区域的舒展。 。。。。。。 。在体表泛素化尝试中,,,,,作者通过引入组蛋白相应地位的突变体,,,,,证明H1对H2AK119ub1舒展的推进作用重要通过扭转染色质高级结构来实现的。 。。。。。。 。并且,,,,,凭据30nm染色质纤维的电镜结构,,,,,作者揣摩这种推进机造可能遵循相间核幼体-核幼体的配对准则[2]。 。。。。。。 。

  多所周知,,,,,DNA复造过程中染色质会经历一次“粉碎-沉建”的过程。 。。。。。。 。在DNA子链上新合成组蛋白的装配会导致组蛋白建饰至少稀释一倍[3, 4],,,,,若是没有有效的组蛋白建饰复原机造,,,,,细胞身份很可贵以维持。 。。。。。。 。那么以上机造是否也介导了H2AK119ub1在细胞周期的继承呢?????利用TetR-TetO靶向系统,,,,,作者发现单纯靶向RING1B在8xTetO左近仅能形成很窄的H2AK119ub1建饰,,,,,当利用多西环素(Doxcycline,,,,,Dox)洗去RING1B-TetR-HA时,,,,,异位形成的H2AK119ub1建饰并不能在子代细胞内得到有效的维持。 。。。。。。 。然而过表白RYBP推进H2AK119ub1向两侧舒展形成约莫10kb的区域时,,,,,尝试发现正反馈机造能介导H2AK119ub1在8xTetO左近维持至少6个细胞周期。 。。。。。。 。同时,,,,,作者发现H1介导的染色质压缩对于H2AK119ub1的遗传也至关沉要。 。。。。。。 。

   另表在全基因组上,,,,,作者发现RYBP突变和H1c/H1d/H1e三敲除导致的H2AK119ub1降低以及基因表白变动有很大水平的沉叠。 。。。。。。 。并且利用神经分化模型,,,,,作者发现RYBP突变和H1c/H1d/H1e三敲除均导致神经前体细胞分化阻碍。 。。。。。。 。因而,,,,,注明RYBP-/YAF2-PRC1复合物和组蛋白H1通过协同推进细胞周期间H2AK119ub1的播散参加了细胞分化过程,,,,,提醒该表观遗传通路拥有沉要的生物学职能。 。。。。。。 。


    参考文件:

  【1】 Gao, Z., et al., PCGF homologs, CBX proteins, and RYBP define functionally distinct PRC1 family complexes. Mol Cell, 2012. 45(3): p. 344-56.

  【2】 Song, F., et al., Cryo-EM study of the chromatin fiber reveals a double helix twisted by tetranucleosomal units. Science, 2014. 344(6182): p. 376-80.

  【3】 Jiang, D. and F. Berger, DNA replication-coupled histone modification maintains Polycomb gene silencing in plants. Science, 2017. 357(6356): p. 1146-1149.

  【4】 Coleman, R.T. and G. Struhl, Causal role for inheritance of H3K27me3 in maintaining the OFF state of a Drosophila HOX gene. Science, 2017. 356(6333).

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