丽江乐投letou生物报路：基于CRISPR的遗传筛选已援手钻研人员鉴定了很多疾病的关键基因，，，，，蕴含镰状细胞性血虚、癌症免疫疗法和肺癌转移等。。。。。。。。然而，，，，，这些遗传筛选的领域很有限，，，，，由于它们只能编纂或靶向DNA。。。。。。。。对于人类基因组的很多区域，，，，，靶向DNA可能无效；；；；；对于其他生物（好比冠状病毒或流感病毒），，，，，现有的CRISPR筛选也无法起作用。。。。。。。。

纽约基因组中心和纽约大学Neville Sanjana博士辅导的钻研团队近日开发出一种靶向RNA的新型CRISPR筛选技术。。。。。。。。他们利用最近鉴定出的Cas13酶，，，，，设计出一个优化平台，，，，，可能在RNA水平上对人类细胞进行大规模的遗传筛选。。。。。。。。这项技术颁发在《Nature Biotechnology 》杂志上，，，，，有助于相识RNA调控的各个方面，，，，，并确定非编码RNA的职能。。。。。。。。

利用人类RNA转录本上数千个分歧位点，，，，，钻研人员开发出一种机械进建的预测模型，，，，，可能援手人们鉴定出最有效的Cas13向导RNA。。。。。。。。此刻，，，，，这项技术向钻研界免费盛开，，，，，可预测特定RNA靶点的向导RNA效能，，，，，并提供所有人类编码基因的预设计向导RNA。。。。。。。。

资深作者Sanjana博士说：“我们预计，，，，，靶向RNA的Cas13酶有望对分子生物学和医学利用产生沉大影响，，，，，但目前对向导RNA的设计还知之甚少。。。。。。。。我们筹算通过深刻而系统的钻研来扭转这一点，，，，，开发出预测模型来实现最有效的向导RNA设计。。。。。。。。”

Cas13酶是IV型CRISPR酶。。。。。。。。与Cas9的分歧在于，，，，，Cas13d结归并切割RNA，，，，，而Cas9切割DNA。。。。。。。。Cas13酶的均匀长度为930个氨基酸，，，，，比其他Cas13酶幼20%，，，，，比Cas9更是幼33%。。。。。。。。在向导RNA的疏导下，，，，，它可能敲低RNA而不扭转基因组。。。。。。。。这种个性使Cas13有望成为潜在医治剂，，，，，在不永远扭转基因组序列的情况下影响基因表白。。。。。。。。

钻研人员开发出一套基于Cas13的新工具，，，，，并在哺乳动物细胞中发展了转录本平铺和分列筛选。。。。。。。。他们总共网络了24,000多个向导RNA的信息。。。。。。。。“我们在多个分歧转录本上平铺了向导RNA，，，，，蕴含一些人类基因，，，，，我们能够通过抗体染色和流式细胞术来轻松测定转录本的敲低，，，，，”第一作者Hans-Hermann Wessels暗示。。。。。。。。

通过这些钻研，，，，，他们相识到向导RNA的哪些区域对指标RNA的鉴别出格沉要。。。。。。。。他们使用了与指标RNA有1个、2个或3个碱基错配的向导RNA，，，，，鉴定出一个关键的“种子”区域，，，，，此区域对于CRISPR向导与指标之间的错配极度敏感。。。。。。。。这个了局可援手科学家设计向导RNA，，，，，以预防脱靶效应，，，，，提高Cas13靶向的特异性。。。。。。。。

钻研幼组最近利用他们的向导RNA预测模型来分析最近肆虐的新型冠状病毒SARS-CoV-2。。。。。。。。对于这种RNA病毒，，，，，钻研人员利用他们的模型鉴定出最佳的向导RNA，，，，，有望利用于将来的检测和医治。。。。。。。。

原文检索

Wessels, H., Méndez-Mancilla, A., Guo, X. et al. Massively parallel Cas13 screens reveal principles for guide RNA design. Nat Biotechnol (2020).