?丽江乐投letou生物报路:组蛋白建饰调控因子（histone modification regulator）是一类能够鉴别、增长或者去除组蛋白建饰的蛋白，，，，，，，，在调控染色质状态和基因转录方面阐扬沉要作用，，，，，，，，也参加多多疾病产生过程，，，，，，，，是潜在的医治靶标。。。。。。。。

近几年的钻研发现，，，，，，，，一些组蛋白建饰调控因子能够独立于其组蛋白建饰底物/产品阐扬职能。。。。。。。。例如，，，，，，，，2012年Myles Brown / 刘幼乐课题组合作发现，，，，，，，，PRC2的主题亚基EZH2能够不依赖于H3K27me3阐扬职能，，，，，，，，而是与AR相互作用激活前列腺癌细胞系中的部门基因；；；；；；2015年寿建勇 / 张勇课题组合作发现SETDB1能够调控幼鼠胚胎干细胞中PRC2的活性，，，，，，，，而该职能不依赖于H3K9me3。。。。。。。。这些钻研批注，，，，，，，，组蛋白建饰调控因子的这些不依赖于其组蛋白建饰底物/产品的非经典职能能够在特定的生物学过程中阐扬沉要作用。。。。。。。。

只管已经有一些组蛋白建饰调控因子非经典职能的报路，，，，，，，，但是并没有推算生物学步骤对这类问题进行系统性的预测。。。。。。。。

来自同济大学同济大学张勇教授课题组和天津医科大学吴旭东教授课题组合作颁发题为ncHMR detector: a computational framework to systematically reveal non-classical functions of histone modification regulators的文章，，，，，，，，开发了预测组蛋白建饰调控因子的非经典职能及其协同因子的推算生物学步骤ncHMR detector。。。。。。。。

这一钻研发现颁布在在Genome Biology杂志上。。。。。。。。

在已知的报路中，，，，，，，，组蛋白建饰调控因子在行使非经典职能时大多与协同因子产生相互作用，，，，，，，，因而ncHMR detector整合分析组蛋白建饰调控因子、组蛋白建饰及转录因子的ChIP-seq数据，，，，，，，，调查给定的组蛋白建饰调控因子是否在部门结合位点上同时出现对应组蛋白建饰的缺失及协同因子的结合，，，，，，，，据此来判断该因子是否拥有非经典职能。。。。。。。。

在这项工作中，，，，，，，，钻研人员通过将ncHMR detector利用到6个公共ChIP-seq数据较多的细胞类型/细胞系中，，，，，，，，预测得到了12个组蛋白建饰调控因子的非经典职能，，，，，，，，其中排名第一的是幼鼠胚胎干细胞中CBX7的非经典职能，，，，，，，，其协同因子为NANOG。。。。。。。。

吴旭东教授课题组在幼鼠胚胎干细胞中验证了CBX7的非经典职能，，，，，，，，并论证了CBX7与NANOG共定位于Nanog基因的加强子，，，，，，，，推进其自身表白，，，，，，，，对于幼鼠胚胎干细胞多能性的维持拥有沉要意思，，，，，，，，这一作用和机造均有别于传统的Polycomb家族蛋白职能。。。。。。。。这项钻研提供了一种系统性地预测组蛋白建饰调控因子非经典职能的推算生物学步骤，，，，，，，，将有助于更好地理解组蛋白建饰调控因子职能的多样性。。。。。。。。

原文标题：

ncHMR detector: a computational framework to systematically reveal non-classical functions of histone modification regulators