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丽江乐投letou生物报路:〖国国度科学院院刊》(PNAS)在线颁发了中国科学院生物物理钻研所周政课题组的钻研论文“Role of a DEF/Y motif in histone H2A-H2B recognition and nucleosome editing”。。。。。。。该钻研揭示了SWR复合物亚基Swc5特异性鉴别组蛋白H2A-H2B并调控组蛋白H2A.Z进行染色质组装的分子机造。。。。。。。
H2A.Z是组蛋白H2A的一类变体。。。。。。。酵母及哺乳动物细胞中的H2A.Z拥有高度守旧的序列,,,,,并且在基因转录、DNA复造、基因组不变性维持等过程中阐扬沉要作用。。。。。。。H2A.Z通过精确定位于基因组的特定位点来扭转染色质结构并实显熹职能。。。。。。。染色质沉塑复合物SWR通过水解ATP开释能量,,,,,逐步将转录肇始位点左近的H2A核幼体代替成H2A.Z核幼体,,,,,从而实现H2A.Z的染色质定位。。。。。。。为了说明SWR的职能以及H2A.Z的染色质定位机造,,,,,近年来周政课题组对H2A.Z互换反映进行了深刻钻研,,,,,先后揭示了H2A.Z移除(Cell Res 2014)、SWR亚基YL1调控H2A.Z组装(Nat Struct Mol Biol 2016)、组蛋白伴侣Chz1调控H2A.Z组装(PLoS Biol 2019)等沉要机造。。。。。。。现有钻研批注,,,,,在SWR催化H2A.Z-H2B组装进入核幼体的同时,,,,,H2A-H2B会从核幼体上产生移除。。。。。。。在此过程中,,,,,SWR亚基Swc5对H2A-H2B的鉴别阐扬着沉要作用,,,,,但其分子机造尚不明显。。。。。。。
通过测定酵母起源的Swc5与H2A-H2B的晶体结构,,,,,钻研人员发现Swc5及其哺乳动物同源蛋白CFDP1均利用一个串联的DEF/Y基序鉴别H2A-H2B。。。。。。。结构显示Swc5利用中心的极性氨基酸辅以两端的疏水氨基酸形成其特有的“三齿模型(tridentatemode)”牢凝结合H2A-H2B,,,,,同时保障其选择性鉴别通例组蛋白H2A而非变体组蛋白H2A.Z。。。。。。。通过等温量热滴定、体表酶活测定以及体内交联等尝试,,,,,钻研人员证实DEF/Y基序在鉴别H2A-H2B、推进组蛋白互换、调节SWR催化活性等过程中拥有沉要作用。。。。。。。该钻研提醒,,,,,当SWR复合物催化H2A.Z互换反映时,,,,,核幼体DNA打开并露出出H2A-H2B上的Swc5结合位点,,,,,Swc5鉴别并结合H2A-H2B会推进后者从核幼体上移除,,,,,从而确保H2A.Z互换反映的顺利进行(图1)。。。。。。。该钻研为说明SWR复合物的职能以及H2A.Z的染色质定位机造奠定了基础。。。。。。。
生物物理所钻研员周政与美国Stony Brook University教授Ed Luk为论文的共同通讯作者。。。。。。。周政课题组博士钻研生黄艳为论文的第一作者。。。。。。。Ed Luk课题组的Lu Sun, Leonidas Pierrakeas、周政课题组出格钻研助理戴霖昌、助理钻研员潘露也参加了该项钻研。。。。。。。该钻研获得国度沉点研发打算、国度天然科学基金、中科院战术性先导科技专项(B类)等赞助,,,,,上海同步辐射光源(SSRF)及生物物理所尝试平台为该钻研提供了沉要的技术支持。。。。。。。
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