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两篇Nature Genetics聚焦神经元核内宽恕体病


丽江乐投letou生物报路:神经元核内宽恕体。。。。。。╪euronal intranuclear inclusion disease,,,,,NIID)是一种罕见的神经退行性疾病,,,,,以中枢和周围神经系统内的嗜酸性通明宽恕体为特点。。。。。。这种疾病的临床症状多变,,,,,无特异性,,,,,使得医生难以诊断。。。。。。

近日,,,,,两个钻研团队利用分歧的测序步骤来揭示NIID患者基因组内的沉复扩增。。。。。。这些成就于本周颁发在《Nature Genetics》杂志上。。。。。。6月,,,,,湘雅医院的唐北沙教授和沈璐教授团队也在《American Journal of Human Genetics》上报路了NIID的沉复扩增。。。。。。

湘雅的团队初次揭示了神经元核内宽恕体病致病机造与NOTCH2NLC基因中GGC异常沉复扩增有关,,,,,并且提出了“NIID有关疾病”(NIID related disorders)这一新概想。。。。。。他们指出该组疾病由NOTCH2NLC基因GGC异常扩增所致,,,,,临床上可能并不罕见,,,,,在某些常见神经退行性疾病如阿尔茨海默病、帕金森综合征患者中同样存在。。。。。。

在两项新钻研中,,,,,一个团队利用长读长测序,,,,,另一个团队利用短读长测序,,,,,来寻找NOTCH2NLC基因左近的扩增。。。。。。其中一个团队在症状类似的其他罕见疾病中也发现了沉复扩增,,,,,这批注沉复扩增在人类疾病中的作用比我们设想中更大。。。。。。

东京大学医学部从属医院的助理教授Hiroyuki Ishiura说:“由于引起这些疾病的突变极度类似,,,,,故所有患者将来可能从一样疗法中受益。。。。。。”他是其中一篇文章的第一作者。。。。。。

第一项钻研由名古屋大学医学钻研所院的Gen Sobue教授辅导。。。。。。钻研人员对一个NIID各人族进行全基因组测序,,,,,这个家族中有多人患有NIID。。。。。。通过连锁分析,,,,,他们将两个基因组区域(1p36.31– p36.22处的3.5 Mb区域和1p22.1–q21.3处的58.1 Mb区域)与疾病有关联,,,,,但无法鉴定出致病性的SNP或CNV。。。。。。

之后,,,,,他们又利用PacBio的SMRT长读长测序技术,,,,,对来自8个家庭的13名患病个别和4名对照个别进行测序,,,,,发现所有患病个别在一个基因组区域出现GGC沉复扩增。。。。。。

这种GGC沉复扩增落在NOTCH2NLC基因的5’UTR左近。。。。。。NOTCH2NLC是与NOTCH2有关的三幼我类特异性基因之一,,,,,在放射状胶质细胞群体中高度表白。。。。。。沉复扩增不呈此刻其他家庭成员或对照个别中。。。。。。

此表,,,,,钻研人员又利用沉复引物PCR技术(RP-PCR)来分析9个无亲缘关系的家庭,,,,,发现所有患病的家庭成员都存在沉复扩增,,,,,而497个对照中的496个没有。。。。。。他们检测的所有40个散发病例也存在扩增。。。。。。

在另一项钻研中,,,,,东京大学医学部从属医院的Ishiura及其同事同样检测了家族性NIID、散发性NIID及对照中的串联沉复。。。。。。不外,,,,,他们不是使用连锁分析和长读长测序步骤,,,,,而是利用短读长测序和Trhist工具的组合,,,,,天生含有串联沉复的短片段直方图。。。。。。

利用这种步骤,,,,,他们分析了来自四个分歧家庭的四名患者的基因组,,,,,以搜索含有CGG沉复扩增的短片段。。。。。。他们也将这种沉复扩增定位到NOTCH2NLC基因的5’ UTR区域,,,,,并通过RP-PCR和Southern blotting证实其存在于NIID患者中,,,,,而不存在于对照中。。。。。。

Ishiura及其同事还利用同样的步骤来寻找其他有关疾病的沉复扩增,,,,,蕴含伴有脑白质病变的眼咽。。。。。。∣PML)、眼咽远端型肌。。。。。。∣PDM)和眼咽肌营养不良症(OPMD)。。。。。。

对于伴有脑白质病变的眼咽病,,,,,他们在LOC642361/NUTM2B-AS1的非编码区域发现了CGG沉复扩增。。。。。。对于眼咽远端型肌病,,,,,他们在LRP12的5’ UTR也发现了CGG沉复扩增,,,,,此基因编码低密度脂蛋白有关蛋白12。。。。。。最后,,,,,他们在眼咽肌营养不良症患者的PABPN1编码区发现了GCG沉复扩增。。。。。。

钻研人员指出,,,,,这些了局批注,,,,,沉复扩增对其他神经系统疾病而言可能也很沉要,,,,,并且很多沉复片段是类似的,,,,,这注明单一种疗法就能应对多种疾病。。。。。。

原文检索

Long-read sequencing identifies GGC repeat expansions in NOTCH2NLC associated with neuronal intranuclear inclusion disease
Nature Genetics (2019) Published: 22 July 2019

Noncoding CGG repeat expansions in neuronal intranuclear inclusion disease, oculopharyngodistal myopathy and an overlapping disease
Nature Genetics (2019) Published: 22 July 2019

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