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华裔牛人Natur子刊发文:哺乳动物分歧细胞组分RNA结构图谱


丽江乐投letou生物报路:RNA结构是转录后调控的基 。。。。。,,,,对于RNA的合成(即转录)、加工(蕴含剪怯注建饰等)、转运、翻译和降解等过程都起着沉要调控作用 。。。。。

来自斯坦福大学,,,,,清华大学的钻研人员颁发了题为“RNA structure maps across mammalian cellular compartments”的文章,,,,,报路了哺乳动物分歧细胞组分RNA结构图谱,,,,,凸起了RNA结构的动态变动个性,,,,,及其在基因调控中的职能意思 。。。。。并深刻解析了RNA结构动态变动的分子机造,,,,,出格是其与RNA建饰、RBP结合之间的互有关系 。。。。。

这一钻研成就颁布在Nature Structural & Molecular Biology,,,,,由斯坦福大学驰名分子生物学家Howard Chang教授,,,,,和清华大学性命科学学院张强锋钻研员实现 。。。。。

Chang教授诞生于台湾,,,,,毕业于哈佛大学,,,,,现任斯坦福大学首席钻研员 。。。。。曾入选HHMI2009年早期职业科学家项目(2009 Early Career Scientist Program),,,,,获得百万美元赞助 。。。。。近几年张教授屡次在Nature等顶级期刊上颁发成就 。。。。。

2015年Howard Chang课题组在《天然》杂志发现的技术icSHAPE能够高通量地获取整个转录组的RNA结构 。。。。。但是,,,,,之前的钻研测得的是细胞内所有RNA的均匀结构,,,,,不能分辨分歧空间散布的细胞组分间RNA结构的差距 。。。。。

在最新钻研中,,,,,钻研人员通过整合亚细胞分离技术与高通量RNA探测技术icSHAPE,,,,,解析了来自于人类和老鼠的两个分歧细胞系染色体上,,,,,细胞核内与细胞质内三个组分的RNA结构 。。。。。

钻研比力了分歧亚细胞定位的RNA结构,,,,,并成立了RNA结构动态变动的位点图谱 。。。。。通过关联钻研,,,,,系统性分析了分歧类型RNA建饰对RNA结构的影响,,,,,以及RNA结构和分歧RNA结合蛋白(RBP)结合之间的互有关系 。。。。。进一步,,,,,基于RNA的结构变动,,,,,将RNA的N6-甲基腺苷建饰(即m6A)的阅读器蛋白(reader)分成直接和间接阅读器(即结构阅读器)蛋白,,,,,以及阅读器和拮抗阅读蛋白 。。。。。论文最后对新发现的m6A拮抗阅读蛋白LIN28A进行了验证 。。。。。

图1. 通过亚细胞分离获取分歧细胞组分高精度的RNA结构组

 

这项钻研凸起了RNA结构的动态变动个性,,,,,及其在基因调控中的职能意思 。。。。。并深刻解析了RNA结构动态变动的分子机造,,,,,出格是其与RNA建饰、RBP结合之间的互有关系 。。。。。

原文标题:

RNA structure maps across mammalian cellular compartments

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