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单细胞RNA测序发现新视网膜神经节细胞亚型


丽江乐投letou生物报路:单细胞测序技术添补了性命科学领域的很多空缺,,,,,依附这项技术,,,,,康涅狄格大学健全中心和杰克逊尝试室(JAX)的钻研人员已经鉴定出了40种视网膜神经节细胞(retinal ganglion cells,,,,,RGCs)亚型,,,,,以及用于分辨它们的遗传象征和转录因子。 。。。。。。

得益于液滴单细胞RNA测序技术(droplet-based single-cell RNA sequencing),,,,,钻研人员此刻能单独分离每个细胞并扩增其遗传物质来探查RNA组成。 。。。。。。这才允许科研人员对给定类型细胞(例如RGCs)进行具体普查,,,,,鉴别它们分歧亚型之间的轻微分子差距。 。。。。。。

RGCs将视觉数据从眼睛传递给大脑,,,,,之前已经鉴别了30种RGCs亚型,,,,,利用单细胞RNA测序,,,,,钻研幼组分析了6225个来自新生幼鼠左右眼的单个RGCs,,,,,检测到约莫5000个表白基因,,,,,通过聚类算法运行所得数据,,,,,将细胞分类为40个子类型。 。。。。。。

由神经科学系教授Ephraim F. Trakhtenberg博士辅导的这项钻研颁发于《Nature Communications》,,,,,他们为生物学领域的一大类问题提供了新参考:细胞的亚型或类型由什么决定?????

哺乳动物中枢神经系统高度复杂,,,,,涉及很多专门的神经元类型和亚型以及它们之间的相互作用。 。。。。。。钻研幼组之所以选择调查RGCs,,,,,是由于与其他重要神经元类型相比,,,,,它们是迄今为止鉴定出最多亚型的一类细胞。 。。。。。。并且,,,,,其他视网膜细胞类型(例如,,,,,光感触器)已经在单细胞水平上被宽泛钻研了。 。。。。。。因而,,,,,钻研人员但愿测定RGCs亚型之间的分子差距,,,,,并找到它们的怪异象征。 。。。。。。

除了鉴定新RGC亚型和生物象征,,,,,钻研人员还指出了将细胞分化为这些亚型所需的基因表白变异量,,,,,并提出了从细胞型群体到亚型群体的档次结构。 。。。。。。目前,,,,,该钻研公开数据可接见UConn Health网站“RGC Subtypes Gene Browser”免费获取。 。。。。。。

原文检索:Single cell transcriptome profiling of retinal ganglion cells identifies cellular subtypes

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