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乐投letou生物报路:癌症有200多种,,,,,每种癌症都是怪异的,,,,,开发精确肿瘤医治的持续致力依然令人望而生畏。。。。。大部门的焦点都集中在开发基因测序测定或分析,,,,,以鉴别癌症驱动基因的突变,,,,,而后尝试匹配可能匹敌这些突变的医治步骤。。。。。仍有很多癌症患者无法从这些早期的靶向医治中获益。。。。。
在2024年4月18日颁发在《Nature Cancer》杂志上的一项新钻研中,,,,,美国国度癌症钻研所的Sanju Sinha博士,,,,,以及美国国立卫生钻研院(NIH)的科学家们描述了一种史无前例的推算蹊径,,,,,能够在单细胞分辨率下系统地预测患者对癌症药物的反映。。。。。
这种新的基于人为智能的步骤被称为基于个性化单细胞表白的肿瘤医治打算——PERCEPTION,,,,,它更深刻地钻研了转录组学的利用——转录因子的钻研,,,,,转录因子是由携带DNA信息并将其转化为行动的基因表白的信使RNA分子。。。。。Sinha和他的同事利用转化进建(transfer learning,,,,,人为智能的一个分支)来构建PERCEPTION,,,,,使用了大规模细胞系药物筛选中可公开获得的、匹配的批量样本(bulk)和单细胞(sc)表白谱,,,,,其中批量样本表白数据用来训练人为智能,,,,,单细胞表白谱用于调整模型。。。。。这些资源有助于成立基于患者单细胞肿瘤转录组学的医治反映模型。。。。。在造就细胞和患者肿瘤源性原代细胞中,,,,,以及在多发性骨髓瘤和乳腺癌的两项临床试验中,,,,,PERCEPTION成功预测了对靶向医治的反映。。。。。在每种情况下,,,,,PERCEPTION都正确地将患者分为应答者和无应答者两类。。。。。在接受酪氨酸激酶抑造剂医治的肺癌患者中,,,,,随着疾病的发展,,,,,它甚至还捉拿到了耐药性的发展,,,,,这是一个拥有巨大潜力的沉大发现。。。。。在所有临床队列中,,,,,PERCEPTION优于已颁发的最先进的基于单细胞和基于批量的预测指标。。。。。这项工作利用肿瘤的单细胞表白谱进行患者分层,,,,,将激励在临床环境当选取单细胞组学分析,,,,,加强基于单细胞组学的精确肿瘤学工具。。。。。PERCEPTION可接见https://github.com/ruppinlab/PERCEPTION。。。。。
“肿瘤是一种复杂而不休进化的野兽。。。。。使用单细胞分辨率能够让我们解决这两个挑战,,,,,”Sinha说。。。。。“PERCEPTION允许使用单细胞组学中的丰硕信息来相识肿瘤的克隆结构并监测耐药性的出现。。。。。(在生物学中,,,,,组学指的是细胞内成分的总和。。。。。) “对我来说,,,,,监测耐药性出现的能力是最令人兴奋的部门。。。。。它有可能让我们适应癌细胞的进化,,,,,甚至批改乐投letou医治战术。。。。。”“来自诊所的有限单细胞数据是我们最大的挑战。。。。。人为智能模型必要大量数据来相识疾病,,,,,就像ChatGPT必要从互联网上抓取大量文本数据一样。。。。。”
Sinha暗示,,,,,PERCEPTION还没有为临床做好筹备,,,,,但是这种步骤批注,,,,,单细胞信息能够用来领导医治。。。。。他但愿激励在诊所选取这项技术,,,,,以产生更多的数据,,,,,这些数据可用于进一步开发和美满临床使用的技术。。。。。“预测的质量随着作为其基础的数据的质量和数量的提高而提高,,,,,”“乐投letou指标是创建一种临床工具,,,,,可能以系统的、数据驱动的方式预测个别癌症患者的医治反映。。。。。我们但愿这些发现能引发更多的数据和更多这样的钻研,,,,,越早越好。。。。。”
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