乐投letou生物报路：蛋白质合成是活细胞中最耗能的过程之一，，，，，，，，其精确调节成为细胞经济的关键问题。。。。。。。固然在全局基因表白分析中，，，，，，，，通常用 RNA 测序 (RNA-seq) 确定的 mRNA 水平作为分析蛋白质合成的代替，，，，，，，，但最终蛋白质丰度并不总是与 mRNA 水平有关。。。。。。。这是由于还有mRNA的转录后调控（幼分子RNA (sRNA)）、翻译调控、翻译后建饰等多种调节机造。。。。。。。

在从前十年中，，，，，，，，核糖体分析 (Ribo-seq) 已成为在转录组领域内评估蛋白质合成速度和钻研翻译节造机造的重要步骤。。。。。。。Ribo-seq 基于对核糖体；；；；；て (RPF)——即mRNA上的核糖体结合位点——进行 RNA-seq 分析，，，，，，，，这些核糖体覆盖/结合的片段可能在细胞裂解后的核酸酶处置过程中保留下来。。。。。。。由于每个核糖体；；；；；て未硪桓龊颂翘宓牡匚唬，，，，，它们的总和不仅揭示了哪些 mRNA，，，，，，，，并且还揭示了这些 mRNA 的编码序列 (CDS) 的哪些部门被翻译，，，，，，，，可用于绘造体内自动翻译核糖体的图谱，，，，，，，，以提供有关翻译暂停、滞碍和翻译肇始位点使用的全局信息，，，，，，，，以及蛋白质拷贝数的估计。。。。。。。

固然 Ribo-seq 极大地推动了翻译有关过程的钻研，，，，，，，，但该步骤也有限度。。。。。。。弱表白基因的覆盖依然拥有挑战性，，，，，，，，导致很多基因——蕴含在正常成长前提下拥有极低表白的某些基因类别，，，，，，，，例如仅由导致细胞殒命或成长抑造的特定压力触颁发财的毒素——难以被检测到。。。。。。。同样，，，，，，，，来自人类肠路的微生物的 Ribo-seq依然很难题，，，，，，，，由于其中很多无法在尝试室中造就。。。。。。。在机造层面上，，，，，，，，Ribo-seq 对那些影响翻译的分子的钻研可能会受到细胞反映的故障。。。。。。。此表，，，，，，，，由于 Ribo-seq 是在活细胞上进行的，，，，，，，，因而很难分解对翻译的直接和间接影响。。。。。。。

为了克服其中的一些限度，，，，，，，，Würzburg大学(JMU)的一个钻研幼组开发一种新技术：体表Ribo-seq (INRI-seq)，，，，，，，，用于以无细胞方式进行全局翻译钻延祝。。。。。。INRI-seq 使用市售的 PURExpress体表翻译系统，，，，，，，，与体表合成的、齐全可自界说的转录组相结合，，，，，，，，可更好地节造单个 mRNA 水平。。。。。。。“我们已经开发了一种技术，，，，，，，，能够用来分析一个齐全可定造的合成转录组的翻译景观，，，，，，，，换句话说，，，，，，，，一个细胞表的转录组，，，，，，，，。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。有了INRI-seq，，，，，，，，就不再必要翻译调节物质穿过细胞膜或从大量活细胞中提取核糖体，，，，，，，，”Vogel是JMU分子习染生物学钻研所的主任，，，，，，，，也是这项钻研的重要作者，，，，，，，，他概述了该技术的优势。。。。。。。“对于那些你想钻研的、通常很宝贵的资料，，，，，，，，好比一种只能幼规模出产的新抗生素，，，，，，，，INRI-seq只必要用更少的资料，，，，，，，，因而能节俭功夫和金钱。。。。。。。”

尝试成功率高

作者将 INRI-seq 利用于合成大肠杆菌转录组并证明该步骤能忠诚地验证已知的翻译肇始位点，，，，，，，，并可用于预测新的翻译肇始位点。。。。。。。与在活细胞上进行的技术上类似的钻研相比，，，，，，，，INRI-seq鉴别了险些四倍多的转译过程肇始位点，，，，，，，，显示出它的高活络度。。。。。。。此表，，，，，，，，他们使用该系统来钻研反义肽核酸 (PNA) 对翻译抑造的保真度，，，，，，，，证明中靶特异性和界说影响这些短反义寡聚体脱靶效应的碱基配对尺度。。。。。。。INRI-seq 作为一种可扩大的活络代替步骤，，，，，，，，拥有巨大的潜力，，，，，，，，可用于钻研其他生物体和生物群落（蕴含真核生物）中的翻译节造机造和翻译调节化合物，，，，，，，，能够在转录组领域内钻研翻译肇始位点，，，，，，，，而不会因从活细胞中提取核糖体而产生潜在混合效应。。。。。。。这是迄今为止使用的步骤的一个显著改进，，，，，，，，他们在最新一期的《核酸钻延追杂志上颁发了他们的钻研成就。。。。。。。